曹操斬華佗是因為華佗挑戰了曹操的權威。曹操性格多疑，認為華佗今后可能會給自己的事業帶來阻礙，于是斬殺華佗。華佗是家喻戶曉的醫學專家，但他有一種常人無法理解的狂妄。雖然身為醫生，還愿意免費為窮人治療，但是他也有一些怪癖，這引起了曹操的反感。

曹操有一種從小伴隨到大的頭痛，在事業關鍵時期，曹操因為頭痛變得行為越來越怪異，他的部下尋遍名醫也沒有找到能治療這種頭痛的醫生，此時一名士兵想起了華佗。據傳這位神醫治好過許多疑難雜癥，甚至曾經讓陳登喝了幾副藥，就治好了困擾他許多天的頑疾。當時還有傳言認為華佗專門醫治疑難雜癥，而且藥到病除，黃疸病也可以得到醫治。在這種情況下，人們找來華佗為曹操看病。

在華佗的治療下，困擾曹操的疾病很快得到緩解，曹操想要將華佗留在身邊作為自己的專屬醫生，但是華佗并不愿意接受這樣的方案。他從小學習醫術就是為了解決疑難雜癥，還將自己的經驗匯集成書，傳給自己的弟子，如果留在曹操身邊，自己的志向一定會受到影響，于是隨便編了一個理由離開了曹操。后來，曹操專門派人查看，發現華佗所言為虛，將華佗逮捕起來，并且判處其死刑。

曾經受到過華佗治療的臣子為華佗求情，但這并不能讓曹操的想法有所動搖，他甚至覺得華佗在挑戰自己的權威，這讓他處死華佗的決心變得更加堅定。一代神醫在這樣的情況下被處死。當時寶貴的醫學經驗以及技術都沒有被流傳下來，這也導致后續中醫的發展受到了一定的影響，但是在當時的歷史環境下，華佗被處死也難以避免。