原子空是基于粒子模型的結論，透明也是一個相對概念，重點是物質能透過那種頻率的電磁波。原子直徑約為10的-10次方米。構成原子的核與電子相比，核如同足球場上的一顆豆子，而電子更小，甚至比塵埃還微小。

一開始，人們也確實這樣認為的。比如說，著名的“α粒子散射實驗”就表明，原子內部真的是一片虛空。物理學家盧瑟福最早做過這個實驗，實驗很簡單，用α粒子轟擊薄薄的金箔。實驗結果顯示，大部分α粒子都能直接穿過金箔，但也有極少數α粒子會發生偏轉，有的偏轉角度甚至能超過150度。盧瑟福認為原子有致密核心，其半徑約為10的14次方米，提出了類似太陽系的“行星模型”。波爾首次解釋了這一問題。波爾在原子行星模型基礎上引入了“能級”概念，認為電子不圍繞原子核運行，而是在不同的能級軌道間躍遷。海森堡進一步提出“不確定性原理”，解釋了電子云的概念。但電子云概念似乎也很難讓物體實在起來，畢竟電子云可以壓縮。

另一個天才物理學家泡利提出了“不相容原理”，認為一個能級上只允許一個電子存在，不允許其他電子存在，如果其他電子試圖進來，就會產生強大的排斥力。如此一來，看起來軟綿綿的“電子云”一下子就會因為斥力表現得很堅硬實在。基本粒子除了電子外，還具有類似特性。"不相容原理"使電子相互排斥，形成電子簡并壓。在中子星形成時，強大引力克服電子壓力，壓縮電子與質子結合成中子。物體大多不透明是因電子吸收光子能量躍遷至不同能級。若光子未被吸收，則可穿透原子，物體則透明。金屬一般是不透明的，而且通常都有金屬光澤。主要是因為金屬中有很多到處亂串的自由電子，這些自由電子不但可以讓金屬導電，還能有效地反射光線，讓金屬表現出金屬光澤。

物體透明與否取決于光是否被電子吸收，吸收則不透明，反之透明。這些概念源自量子力學。在量子領域，一切都不確定。然而，這種不確定性構成了我們宏觀世界的確定性。量子世界的奇異性讓人難以理解，如微觀粒子具有波粒二象性，至今未能解釋。